RT，文本形式也可以
xmind有linux版本呀

vimwiki，偶尔freemind～

freemind

graphviz

xmind全平台，而且freemind的字体我怎么也弄不好，看着别扭

freemind是文本文件，可以用版本控制。
xmind是压缩包。

UML系列的用Dia了，比较朴素。
脑图系列用xmind了，装portable版
graphviz 比较适合程序生成，人工操作起来并没有Dia方便
当然，还可以直接用一些在线的工具，比如https://www.gliffy.com

Workflowy 神器

xmind + Markdown

像写论文样:
1
1.1
2
2.1
2.2
3
3.1
3.2
3.2.1
3.2.2
3.3
4














感谢回复，昨天试用了几个，值得一提的是graphviz好特别，所想即所得。