帮公司的设计们写点 PS 的小工具，用到了 extendscript, 其他的就不说了, 看代码吧...

if (typeof arg === "number") {
  // do something
  return
}

// 问题是, 下面的问题, 在这儿加一个 log, 就不会出现了
// 而 log 函数只是对 alert 函数的一个封装(将输入转成字符串)
// log(4)

if (typeof arg === "string") {
  // 能想象, 这里面会 typeof arg === "number" 吗?
  // 上面的 return 也正常执行了
  // 这个 log 也是紧贴着判断语句的, 不存在修改变量的问题
  // 就是这么魔幻...
  log(typeof arg)
  return
}

反复看了几遍，语病好多，没看明白你想表达什么。
一开头就直接“问题是”，那前面的文字忘打了还是没贴全？

从 if (typeof arg === "string") 开始看就好了